Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DENRO43583 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENRO43583 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENRO43583 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENRO43583 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENRO43583 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DENRO43583 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENRO43583 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENRO43583 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENRO43583 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENRO43583 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DENRO43583 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DENRO43583 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DENRO43583 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DENRO43583 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENRO43583 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENRO43583 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DENRO43583 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DENRO43583 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENRO43583 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DENRO43583 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENRO43583 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENRO43583 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENRO43583 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DENRO43583 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DENRO43583 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DENRO43583 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENRO43583 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DENRO43583 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENRO43583 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENRO43583 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENRO43583 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DENRO43583 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENRO43583 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENRO43583 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENRO43583 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DENRO43583 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENRO43583 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENRO43583 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENRO43583 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENRO43583 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DENRO43583 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DENRO43583 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENRO43583 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DENRO43583 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DENRO43583 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENRO43583 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENRO43583 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DENRO43583 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENRO43583 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DENRO43583 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DENRO43583 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DENRO43583 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms