Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SMAD6O43541 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMAD6O43541 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMAD6O43541 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMAD6O43541 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMAD6O43541 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms