Protein–RNA interactions for Protein: O43426

SYNJ1, Synaptojanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ1O43426 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC42.27■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
SYNJ1O43426 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.23■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
SYNJ1O43426 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
SYNJ1O43426 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC42.12■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC42.08■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
SYNJ1O43426 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC42.06■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC42.02■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
SYNJ1O43426 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
SYNJ1O43426 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms