Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXA3O43365 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXA3O43365 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXA3O43365 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA3O43365 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA3O43365 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXA3O43365 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms