Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARHGEF9O43307 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGEF9O43307 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ARHGEF9O43307 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGEF9O43307 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms