Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MAP3K13O43283 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MAP3K13O43283 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MAP3K13O43283 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms