Protein–RNA interactions for Protein: O35936

Alox8, Arachidonate 8S-lipoxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alox8O35936 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Alox8O35936 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alox8O35936 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alox8O35936 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Alox8O35936 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Alox8O35936 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Alox8O35936 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Alox8O35936 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Alox8O35936 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Alox8O35936 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Alox8O35936 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Alox8O35936 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Alox8O35936 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Alox8O35936 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alox8O35936 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alox8O35936 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Alox8O35936 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Alox8O35936 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Alox8O35936 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alox8O35936 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alox8O35936 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alox8O35936 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Alox8O35936 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Alox8O35936 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Alox8O35936 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alox8O35936 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Alox8O35936 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alox8O35936 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alox8O35936 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alox8O35936 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Alox8O35936 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms