Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rabep1O35551 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rabep1O35551 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rabep1O35551 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rabep1O35551 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rabep1O35551 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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