Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc27a2O35488 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc27a2O35488 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc27a2O35488 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc27a2O35488 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a2O35488 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms