Protein–RNA interactions for Protein: O35199

Vmn2r89, Putative pheromone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r89O35199 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Vmn2r89O35199 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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Vmn2r89O35199 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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Vmn2r89O35199 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Vmn2r89O35199 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Vmn2r89O35199 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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Vmn2r89O35199 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r89O35199 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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Vmn2r89O35199 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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Vmn2r89O35199 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r89O35199 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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Vmn2r89O35199 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Vmn2r89O35199 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Vmn2r89O35199 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Vmn2r89O35199 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Vmn2r89O35199 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Vmn2r89O35199 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn2r89O35199 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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