Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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H2-Q1O19441 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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H2-Q1O19441 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
H2-Q1O19441 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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H2-Q1O19441 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
H2-Q1O19441 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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H2-Q1O19441 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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H2-Q1O19441 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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H2-Q1O19441 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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H2-Q1O19441 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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H2-Q1O19441 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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H2-Q1O19441 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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H2-Q1O19441 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2-Q1O19441 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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H2-Q1O19441 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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H2-Q1O19441 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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