Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLR2DO15514 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLR2DO15514 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLR2DO15514 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLR2DO15514 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms