Protein–RNA interactions for Protein: O15498

YKT6, Synaptobrevin homolog YKT6, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YKT6O15498 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YKT6O15498 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
YKT6O15498 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
YKT6O15498 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YKT6O15498 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
YKT6O15498 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
YKT6O15498 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YKT6O15498 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
YKT6O15498 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
YKT6O15498 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YKT6O15498 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YKT6O15498 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YKT6O15498 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YKT6O15498 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
YKT6O15498 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
YKT6O15498 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
YKT6O15498 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
YKT6O15498 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
YKT6O15498 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
YKT6O15498 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YKT6O15498 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YKT6O15498 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YKT6O15498 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
YKT6O15498 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YKT6O15498 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YKT6O15498 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
YKT6O15498 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YKT6O15498 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YKT6O15498 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YKT6O15498 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YKT6O15498 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YKT6O15498 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YKT6O15498 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YKT6O15498 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YKT6O15498 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YKT6O15498 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YKT6O15498 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YKT6O15498 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YKT6O15498 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YKT6O15498 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
YKT6O15498 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YKT6O15498 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YKT6O15498 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YKT6O15498 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
YKT6O15498 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YKT6O15498 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YKT6O15498 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
YKT6O15498 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YKT6O15498 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YKT6O15498 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YKT6O15498 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
YKT6O15498 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YKT6O15498 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YKT6O15498 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YKT6O15498 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YKT6O15498 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
YKT6O15498 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YKT6O15498 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms