Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CEP290O15078 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP290O15078 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP290O15078 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CEP290O15078 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP290O15078 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP290O15078 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP290O15078 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CEP290O15078 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CEP290O15078 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CEP290O15078 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP290O15078 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CEP290O15078 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP290O15078 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CEP290O15078 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP290O15078 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP290O15078 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP290O15078 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP290O15078 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP290O15078 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP290O15078 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP290O15078 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP290O15078 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP290O15078 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP290O15078 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP290O15078 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP290O15078 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CEP290O15078 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP290O15078 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CEP290O15078 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CEP290O15078 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CEP290O15078 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP290O15078 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CEP290O15078 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CEP290O15078 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CEP290O15078 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CEP290O15078 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CEP290O15078 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP290O15078 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP290O15078 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CEP290O15078 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CEP290O15078 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CEP290O15078 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP290O15078 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP290O15078 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CEP290O15078 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CEP290O15078 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP290O15078 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP290O15078 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP290O15078 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP290O15078 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP290O15078 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP290O15078 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CEP290O15078 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP290O15078 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP290O15078 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CEP290O15078 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP290O15078 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CEP290O15078 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms