Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCKDKO14874 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BCKDKO14874 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BCKDKO14874 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BCKDKO14874 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms