Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARID1AO14497 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID1AO14497 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARID1AO14497 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms