Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Hdac1O09106 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hdac1O09106 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hdac1O09106 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hdac1O09106 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hdac1O09106 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms