Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Eftud2O08810 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Eftud2O08810 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eftud2O08810 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eftud2O08810 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms