Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Dctn1O08788 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Dctn1O08788 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Dctn1O08788 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Dctn1O08788 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Dctn1O08788 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms