Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rundc3aO08576 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rundc3aO08576 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rundc3aO08576 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms