Protein–RNA interactions for Protein: O00750

PIK3C2B, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2BO00750 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
PIK3C2BO00750 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
PIK3C2BO00750 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
PIK3C2BO00750 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
PIK3C2BO00750 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
PIK3C2BO00750 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms