Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.051e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-219ENST00000640178 2446 ntTSL 521.28■■□□□ 11e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-214ENST00000639088 1451 ntTSL 520.93■□□□□ 0.941e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.851e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.821e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.781e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.751e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-212ENST00000638929 3035 ntTSL 218.62■□□□□ 0.571e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.231e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-220ENST00000640360 4437 ntTSL 511.51□□□□□ -0.571e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.181e-36■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SERPINE2-205ENST00000432738 988 ntTSL 315.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 SERPINE2-203ENST00000409840 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 IMPAD1-202ENST00000517461 487 ntTSL 513.17□□□□□ -0.32e-20■■■■■ 57.3
DDX3XO00571 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 523.12■■□□□ 1.292e-13■■■■■ 57.2
DDX3XO00571 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 324.45■■□□□ 1.53e-22■■■■■ 57.1
DDX3XO00571 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 57.1
DDX3XO00571 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 57.1
DDX3XO00571 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.543e-22■■■■■ 57.1
DDX3XO00571 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.753e-22■■■■■ 57.1
DDX3XO00571 TINAGL1-209ENST00000481165 4759 ntTSL 216.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-228ENST00000582626 573 ntTSL 318.71■□□□□ 0.591e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.071e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-207ENST00000478416 878 ntTSL 214.17□□□□□ -0.141e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-229ENST00000584444 782 ntTSL 312.03□□□□□ -0.481e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-220ENST00000578101 4148 ntTSL 211.82□□□□□ -0.521e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.691e-13■■■■■ 57
DDX3XO00571 RPN1-208ENST00000497415 547 ntTSL 419.19■□□□□ 0.661e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.51e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 RPN1-202ENST00000476931 526 ntTSL 417.67■□□□□ 0.421e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.321e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 RPN1-204ENST00000481168 751 ntTSL 212.56□□□□□ -0.41e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 RPN1-206ENST00000495462 566 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-20■■■■■ 56.9
DDX3XO00571 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.474e-12■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.82e-8■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 TLCD1-203ENST00000580518 578 ntTSL 313.76□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.832e-29■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-29■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-29■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 NDUFB10-203ENST00000565031 958 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-29■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 NDUFB10-205ENST00000570172 495 ntTSL 311.44□□□□□ -0.582e-29■■■■■ 56.8
DDX3XO00571 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.62e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 MFSD3-203ENST00000528047 1433 ntTSL 322.79■■□□□ 1.241e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.211e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 CBR1-204ENST00000466328 595 ntTSL 421.81■■□□□ 1.082e-14■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.082e-14■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.982e-14■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-207ENST00000565410 600 ntTSL 221.05■□□□□ 0.961e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-206ENST00000564946 2117 ntTSL 219.84■□□□□ 0.771e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.761e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-201ENST00000287463 2124 ntTSL 219.73■□□□□ 0.751e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.751e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-205ENST00000563399 554 ntTSL 419.55■□□□□ 0.721e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 ZNF77-202ENST00000588050 549 ntTSL 419.4■□□□□ 0.71e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-211ENST00000568754 856 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-203ENST00000421374 2565 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-14■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 TMEM120A-202ENST00000431867 872 ntTSL 517.9■□□□□ 0.462e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 TMEM120A-204ENST00000440632 1352 ntTSL 517.63■□□□□ 0.412e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.341e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.341e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-14■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-212ENST00000569864 528 ntTSL 316.69■□□□□ 0.261e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 PRR14-204ENST00000563211 786 ntTSL 515.12■□□□□ 0.011e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPRTN-206ENST00000492437 603 ntTSL 214.99□□□□□ -0.011e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.091e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-206ENST00000465637 563 ntTSL 414.1□□□□□ -0.151e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-210ENST00000496962 684 ntTSL 213.78□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.311e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPRTN-202ENST00000295050 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.321e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-204ENST00000428479 533 ntTSL 412.85□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 ABCA3-203ENST00000563623 3649 ntTSL 1 (best)12.82□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-202ENST00000416735 566 ntTSL 412.81□□□□□ -0.361e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.431e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-202ENST00000421496 540 ntTSL 411.61□□□□□ -0.551e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-208ENST00000481541 600 ntTSL 211.34□□□□□ -0.591e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-201ENST00000314328 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-204ENST00000437398 6674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-203ENST00000423570 1339 ntTSL 1 (best)11.09□□□□□ -0.631e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-205ENST00000430215 2314 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.71e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 TMEM120A-211ENST00000485200 590 ntTSL 39□□□□□ -0.972e-24■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.21e-12■■■■■ 56.7
DDX3XO00571 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-15■■■■■ 56.6
DDX3XO00571 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 319.6■□□□□ 0.731e-16■■■■■ 56.6
DDX3XO00571 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.783e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.773e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 MRPL3-209ENST00000511168 1377 ntTSL 217.78■□□□□ 0.443e-8■■■■■ 56.5
DDX3XO00571 MRPL3-210ENST00000512877 659 ntTSL 317.51■□□□□ 0.393e-8■■■■■ 56.5
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