Protein–RNA interactions for Protein: O00567

NOP56, Nucleolar protein 56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56O00567 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NOP56O00567 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NOP56O00567 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NOP56O00567 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP56O00567 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP56O00567 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP56O00567 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NOP56O00567 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP56O00567 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NOP56O00567 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NOP56O00567 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP56O00567 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP56O00567 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP56O00567 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP56O00567 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NOP56O00567 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NOP56O00567 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NOP56O00567 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NOP56O00567 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NOP56O00567 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP56O00567 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP56O00567 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NOP56O00567 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NOP56O00567 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NOP56O00567 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP56O00567 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP56O00567 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NOP56O00567 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NOP56O00567 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP56O00567 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NOP56O00567 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms