Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3FO00303 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EIF3FO00303 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.5 ms