Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TULP1O00294 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP1O00294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP1O00294 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TULP1O00294 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TULP1O00294 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TULP1O00294 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TULP1O00294 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP1O00294 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP1O00294 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP1O00294 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TULP1O00294 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TULP1O00294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP1O00294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP1O00294 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP1O00294 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP1O00294 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TULP1O00294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TULP1O00294 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TULP1O00294 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TULP1O00294 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TULP1O00294 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP1O00294 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP1O00294 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TULP1O00294 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TULP1O00294 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TULP1O00294 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP1O00294 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TULP1O00294 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TULP1O00294 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP1O00294 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TULP1O00294 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TULP1O00294 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TULP1O00294 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms