Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC44.53■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.52■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.52■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC44.51■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.51■■■■■ 4.72
SUPT5HO00267 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.5■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.48■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC44.48■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.46■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.45■■■■■ 4.71
SUPT5HO00267 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
SUPT5HO00267 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.35■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC44.34■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC44.34■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
SUPT5HO00267 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC44.31■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC44.3■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC44.28■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.27■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.26■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
SUPT5HO00267 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.25■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC44.23■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.21■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC44.2■■■■■ 4.67
SUPT5HO00267 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC44.18■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.16■■■■■ 4.66
SUPT5HO00267 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms