Protein–RNA interactions for Protein: O00178

GTPBP1, GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1O00178 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTPBP1O00178 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GTPBP1O00178 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GTPBP1O00178 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GTPBP1O00178 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms