Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
J3QQQ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QQQ9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QQQ9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QQQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
J3QQQ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
J3QQQ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
J3QQQ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QQQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QQQ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QQQ9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QQQ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
J3QQQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
J3QQQ9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
J3QQQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
J3QQQ9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
J3QQQ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QQQ9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QQQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
J3QQQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QQQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QQQ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QQQ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QQQ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
J3QQQ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
J3QQQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.1 ms