Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smim22J3QP37 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smim22J3QP37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smim22J3QP37 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smim22J3QP37 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smim22J3QP37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms