Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms