Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CROCC2H7BZ55 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CROCC2H7BZ55 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CROCC2H7BZ55 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CROCC2H7BZ55 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
CROCC2H7BZ55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CROCC2H7BZ55 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms