Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pot1bH7BX60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pot1bH7BX60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pot1bH7BX60 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pot1bH7BX60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms