Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC2LH3BP13 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC2LH3BP13 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRAPPC2LH3BP13 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms