Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BNC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BNC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BNC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BNC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BNC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BNC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BNC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BNC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BNC9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BNC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BNC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BNC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BNC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BNC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BNC9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BNC9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BNC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BNC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BNC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BNC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BNC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
H3BNC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BNC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
H3BNC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
H3BNC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BNC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BNC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BNC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BNC9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
H3BNC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BNC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BNC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BNC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
H3BNC9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
H3BNC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BNC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BNC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BNC9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BNC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
H3BNC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BNC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BNC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
H3BNC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BNC9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BNC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
H3BNC9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BNC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
H3BNC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
H3BNC9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
H3BNC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
H3BNC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BNC9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BNC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BNC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BNC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
H3BNC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
H3BNC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
H3BNC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms