Protein–RNA interactions for Protein: G5E9R7

KRTAP4-16, HCG2042993, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-16G5E9R7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP4-16G5E9R7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRTAP4-16G5E9R7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
KRTAP4-16G5E9R7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms