Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox13F6YCR7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox13F6YCR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox13F6YCR7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox13F6YCR7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms