Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
Crocc2F6XLV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Crocc2F6XLV1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Crocc2F6XLV1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Crocc2F6XLV1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
Crocc2F6XLV1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Crocc2F6XLV1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Crocc2F6XLV1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms