Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28305F6U473 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm28305F6U473 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm28305F6U473 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm28305F6U473 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms