Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm28374F6SG70 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm28374F6SG70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm28374F6SG70 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms