Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Syngap1F6SEU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syngap1F6SEU4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Syngap1F6SEU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syngap1F6SEU4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 344.3 ms