Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc146E9Q9F7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc146E9Q9F7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc146E9Q9F7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc146E9Q9F7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms