Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D3

Ccdc121, Coiled-coil domain-containing 121, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc121E9Q6D3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc121E9Q6D3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc121E9Q6D3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc121E9Q6D3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc121E9Q6D3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc121E9Q6D3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms