Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
6430550D23RikE9Q1X6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
6430550D23RikE9Q1X6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms