Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rpl3lE9PWZ3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rpl3lE9PWZ3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rpl3lE9PWZ3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rpl3lE9PWZ3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms