Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PROB1E7EW31 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PROB1E7EW31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PROB1E7EW31 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROB1E7EW31 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms