Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Atp6ap1lD3Z5W0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms