Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim12cD3Z3L3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim12cD3Z3L3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim12cD3Z3L3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim12cD3Z3L3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms