Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ldlrad1D3YYZ1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ldlrad1D3YYZ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ldlrad1D3YYZ1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ldlrad1D3YYZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms