Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CatipB9EKE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CatipB9EKE5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CatipB9EKE5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CatipB9EKE5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CatipB9EKE5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CatipB9EKE5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms