Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AU015836B2RUM3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AU015836B2RUM3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
AU015836B2RUM3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AU015836B2RUM3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms